儿童群体保健科组建于2010年，前身为群体保健科中一部分。现有医务人员6名，其中副主任医师2人，主管医师2名，医师1名，其中获硕士学位5名，分管婴幼儿保健，新生儿保健，学龄前儿童保健，生命监测、儿科质量、新生儿遗传代谢病筛查，听力及耳聋致病基因筛查，先天性心脏病筛查等工作条目。目前管理机构包括助产机构17家，社区儿童保健49个社区中心、11个社区卫生服务站/横管单位，幼儿园273所。