妇幼信息科于2013年12月正式成立，之前在2012年先建立的妇幼信息组。现有医务人员2人，工程师1人，其中副主任医师1人，主管医师1人，均为硕士研究生。主要负责北京市妇幼保健网络信息系统运维管理、妇幼业务信息管理、国家妇幼卫生监测项目以及出生医学证明管理工作。目前管理的机构涵盖辖区承担妇幼保健工作的100余所医疗卫生机构和近300所托幼机构。