孕产保健科成立于2021年1月，由妇女保健科分出并独立成科，隶属于保健部和孕产保健部下设科室。目前科室7人，其中副主任医师1人，主治医师和主管医师4名，医师2名。孕产保健科在海淀区卫生健康委员会领导下， 承担辖区孕产保健管理的服务职责，包括：孕产保健管理工作、围产保健管理工作、消除艾滋病、梅毒和乙肝母婴传播工作、孕产期心理保健工作、爱婴医院和母婴友好医院建设、生育友好医院建设、产前筛查、产前诊断和出生缺陷监测工作、生育咨询工作、孕期营养工作、辅助生殖和产科的衔接管理、助产机构和人员的培训、考核等。目前管理辖区17家助产机构、58家社区卫生服务机构、17家产前筛查机构、4家产前诊断机构和8家辅助生殖机构。