2004年起设立院级科研课题管理基金，每年投入20-70万元支持科学研究,2004年立项32项、 2005年立项7项、2006年立项5项;2007年立项15项、2017年立项14项。
      2000年至今共承担国家级、北京市级、海淀区级及各类基金会、学会协会等立项单位的科研项目204项,其中自主申报87项，合作项目117项,获得经费资助1272.1万。  
      2000年12月，经海淀区卫生局批准,本院成为北京市海淀区继续医学教育基地，成立了继续教育委员会,是海淀区继续教育医疗和护理基地，管理规范化，教育制度化，教学多样化，每年选派医护人员走出去参加全国、市、区的培训，并请进知名专家来院讲课、查访、带教，同时支持和鼓励医护人员参加学历教育和各种学会、协会及上网学习，每年为继续医学教育投入大量经费,同时申 办北京市一类继续医学教育项目在我院授课，为医务人员创造更多的学习机会。我院的各专业专家不但承担着海淀区继续医学教育基地的培训项目，同时也先后有妇科、产科、儿科的专家走出去到北京市进行市级继续医学教育项目的培训。
2003年发表科研论文36篇，至今共发表1034篇，其中核心期刊807篇,2006年开始发表SCI 论文至今共发表26篇;2009年开始出版专著,至今共66部，其中主编50部、副主编4部、参编12部; 译著3部，其中主译1部、参译2部。  
       2004年3月，开始承担海淀卫生学校的教学任务。2008年起，承担内蒙古锡林郭勒职业学校医学院的助产、护理的教学任务。2009年，成为中华护理学会助产专科培训基地。2010年，成为全国首批“促进自然分娩、保障母婴健康”培训基地。2016年,成为北京大学护理学院教学医院。
2006年9月，成为华中科技大学同济医学院教学医院，承担着妇幼实习生班和研究生课程进修班教学任务。2007年4月8日，我院迎来2006年正式挂牌为华中科技大学同济医学院教学医 院后第一批同济医学院妇幼卫生专业的实习生8人来院实习。2008年1月18日，赴武汉参加中华科技大学同济医学院公共卫生学院召开的“孕妇医学专业实习基地教学研讨会”。我院5名相关专家受聘为兼职教授、副教授职称(聘期为2008年1月~2012年12月),分别是:张运平、张雪峰、 贾平英为兼职教授,彭振耀、刘晓红为兼职副教授。2008年4月12日，华中科技大学同济医学院、海淀区妇幼保健院研究生课程进修班、举行开学典礼,40名学员分别来自北京十八个区县的妇幼保健院。2011年华中科技大学同济医学院公共卫生学院再次聘请我院5名专家为兼职教授，分别 为马祥君、李智、周钰、赵温、徐艳(聘期为2011年4月~2016年3月),至此我院共计有10名专家 被聘为兼职教授。  
       2008年6月，举办“海淀区妇幼保健院首届教学授课比赛”,共21人参赛，一等奖一名产二病区黄萍，二等奖二名产三病区沈红玲和产一病区丁翔，三等奖三名，分别为儿童早期发展中心盛 晖、病理科王军、生殖中心王慧春,优秀奖4名，分别是手术室王雷、乳腺病防治中心汪洁、口腔科寇艳松和新生儿科徐萍。  
       2010年6月，张运平、张雪峰、彭振耀、马祥君、刘晓红为南昌大学公共卫生专业兼职硕士研究生指导教师(2010年6月~ 2013年6月)。南昌大学妇产科学研究生黄千峰2012年6月毕业，导师张运平;南昌大学儿科学研究生肖玲玲2012年6月毕业，导师张雪峰。南昌大学妇产科学研究生郝玲2014年6月毕业，导师张运平;南昌大学妇产科专业研究生陈林蕾2017年6月毕业，导师 刘晓红。  
       2011年11月，海淀区妇幼防保社区培训基地首届开班，共10名学员，培训科室为儿童早期发展，之后我院妇女保健、儿童保健、预防保健、检验、健康教育、眼保健和孕产妇营养等专业均作为海淀区妇幼防保社区培训基地每年开设培训。  
       2014年3月，成为首教师范大学教育学院研究生实习基地(签署协议)，彭振耀、闫琦、李荣萍为硕士生指导教师。首教师范大学应用心理专业姜霁航2017年6月毕业，基地导师李荣萍。  
       2017年7月，成为北京大学医学部公共卫生学院科研教学基地。带教研究生一人王曼丽，基地导师周钰。  
       2018年3月，成为北京大学心理与认知科学学院科研教学基地。  
       从2000年开始招收来自全国各地的进修人员，共1520名，涉及妇产科、儿科、外科、麻醉、影像、检验、病理、口腔、助产、儿童早期发展等各个专业。2017年，为更好的提升我院带教水平与进修生对临床等不同科室作用，规范招收对象,对外加大宣传，向全院各专业征集招收进修生条件等 要求,修改并完善招生简章，包括规范“进修医务人员资质要求”，明确“接收进修医务人员科室及专业设置”、“进修计划及培养目标”,制定“海淀区妇幼保健院进修申请程序”,修订“医务人员进 修申请表”。    
       2017年9月，我院作为海淀区区级危重症孕产妇抢救培训指定医院带教海淀区社区卫生服务中心围产保健骨干人员51人，带教科室产科四个病区、产科门诊、妇科门诊、产前筛查门诊和乳腺 病防治中心。